Me pasaba igual: NO andaba el Led para los grupos de whatsapp que tenia silenciados. Yo lo pude solucionar siguiendo algunas instrucciones de este post, + algunos agregados. Lo que hice fue lo siguiente:
En Whatsapp entrar a cada grupo. sacarle la opción silenciar (o sea dejarlo para que suene). Luego ir a INFO DEL GRUPO. alli elegir NOTIFICACIONES PERSONALIZADAS y activarlo. En TONO DE NOTIFICACION hay que seleccionar de la lista de tonos el "silencioso" y luego seleccionar el color de luz que uno quiera.
Con eso funciona "casi" perfectamente como antes. Digo casi, porque igual hace la vibracion. Pero no hubo manera que anduviera si le sacaba tb la vibracion. O sea...