Ya esta solucionado.
Intentando solucionarlo se me bloqueó el modo download, creo que fue debido a que en el flasheo de la ROM global con MIUI 8.1 MiFlash al final daba error.
Me encontré con este hilo del redmi 3 que me hizo un hard reset y me soluciono el problema, aunque siguiendo estos paso debería haber ocurrido otra cosa.
Aquí dejo el enlace para cualquiera que pueda ocurrilo algo parecido (la solución esta en la pag.2 en el mensaje #30)
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=1147049&page=2