Creo que ya no se puede. Al parecer, con una aplicación llamada Package Disabler Pro podías congelar el proceso que controla las actualizaciones y eliminar esa notificación. Lo que pasa es que con la última versión ya no puedes congelar dicho proceso, por lo que juraría que ya no hay manera.
Para evitarlo, lo que yo hice en su momento fue desactivar la descarga automática y así ya no aparece el aviso.
A ver lo que te contesta el resto. Espero estar equivocado. Saludos!