Antes de nada tienes que ser Root (se ha comentado en varios hilos de este mismo subforo).
Una vez seas root, simplemente debes ejecutar la aplicación de Titanium Backup y te aparece una lista de aplicaciones.
Para cada aplicación puedes seleccionar las opciones de "congelar" (la dejas en standby pero sin eliminarla) o bien hacer una copia de seguridad de la aplicación (también existen otras opciones que no vas a utilizar). No tendrás ninguna duda con esta aplicación ya que es muy sencilla.
Te recomiendo eso sí, que te leas detenidamente los hilos referentes a hacer root y las implicaciones que ello conlleva.