Saludos , a mi me pasa aveces y lo soluciono reinstalando.
Instalo la rom - instalo el supersu- wip cache y dalvik?-reinicio y no tengo supersu-.
Vuelvo al twrp reinstalo el supersu- wip cache y dalvik?-reinicio y funciona.
Pd: Igual es una tonteria pero puedes probar con SuperSU-v2.79-201612051815.zip. Suerte
