Vamos por partes, y que conste que te habla un linuxero de pro.
Ahora mismo el problema de conectividad entre linux y la AT se debe al protocolo MTP que usa esta última como sistema de transferencia (es el mismo que los mp3 o mp4 por ejemplo). Al ser este un protocolo que hay que configurar aparte en linux suele dar bastantes problemas, te debería de ir (a mi me funciona) sí sigues los tutos que hay en el foro, en caso de que eso no te funcione te doy una pista, prueba a cambiar el nombre de la carpeta de"transformer" a otro, por ejemplo "tf101".
Ten claro que aún así la transferencia de archivos te irá regular, (lentitud, bloqueos en nautilus, archivos que no se copian...)
Por otro lado, el ser root no tiene nada que ver en esto, yo he probado la conexión con y sin root y es igual. Mi opinión personal, ser root, sí, fundamental.
Mi consejo, usa otros medios, por ejemplo tarjeta sd, sí tienes el dock mediante lápiz usb...
Desgraciadamente ahora mismo para linux es un mojón la implementación del AT.
Para conseguir que me andara el adb he tardado dos semanas.
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