Hola Ogam,
La partición que hace el Recovery es en formato ext3
También puedes usar el mismo Recovery para hacer un backup (partición ext incluída) y después restauralo todo o por partes (desde la opción Restore/Advanced)
Si sólo quieres clonar y/o restaurar la partición ext tienes este tutorial:
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=182256
El tamaño máximo de la partición ext es de 2GB, aunque como comenta Sharklâsh yo también creo que con 1GB sobra.
Por último, ya que has de cambiar de tarjeta yo aprovecharía para empezar de cero
Saludos!!