Si la cm 13 se reinicia deberías volverla a Fhasear de manera limpia, con todos lo wipes correspondientes.
Si lo q quieres es volver a mm stock, lo puedes hacer sin
problemas con el flasheador de firmwares oficiales de Alkalinorap, en roms y desarrollo está.
El tema de las otas, si bajas de versión de Android, siempre hablando de firmwares oficiales, no puedes actualizar x ota x q te cargas el bootloader y no tiene solución, estando en mm q es la versión mas alta q tiene este móvil si hay una ota si puedes actualizar, sin ningún problema, pero el tlfn tiene q estar totalmente stock sin tocar nada, q es como queda si le flasheas el firmware stock.
Vamos q si bajas de versión de Android olvídate de las otas,si quieres volver a subir de versión de Android hay q Flashear la stock.