Es raro pero puedes probar abrir el supersu y si tienes aplicaciones que le han pedido permiso ,es que eres root.Prueba algunas opciones:rootearlo de nuevo,actualizar binarios de supersu,prueba el fastergps.
Nota:A mi tambien me pasa pero tiene que ser el programa xke yo tengo acesso root,ya somos 2,algo falla aqui,el root no puede ser xk sino no podria ver archivos ocultos,desinstalar aplicaciones del sistema etc,llevo la P16 rooteada de Alberto96,tengo el supersufree(igual es x eso),voy a flashear el supersu y no lo voy actualizar a ver que pasa