Desconozco si alguien se dedica a hacer ZIPs flasheables, efectivamente no me extrañaría que los hubiera.
Puedes actualizar sin perder datos, modificando el flash-all.bat, eliminando el "-w". Después podrías volver a instalar TWRP y flashear el root de nuevo. Lo más seguro es que después tengas problemas con el acceso root para las apps, puesto que no sé si recordará los permisos.
Yo también me he visto en esta situación muchas veces, que tienes tantas apps y configuraciones que te repatea tener que hacer instalación limpia. Pero es lo más recomendable, sobre todo cuando hay grandes cambios en la base de Android. Personalmente prefiero llevar ROMs modificadas que te traen todas las novedades y pocas veces tienes que hacer instalación limpia.
Un saludo!!