Bueno, viendo que en mi caso no se solucionaba, he flasheado la MIUI8 stable vía fastboot a la desesperada. Ya va bien el tema de la batería. Después he instalado TWRP y una de las CM14 que andan por ahí y sigue funcionando correctamente.
Por curiosidad, los que tenéis estos problemas habéis tenido instalada alguna build de Team Superlumial? Sospecho que algo tienen estas roms (o el TWRP modificado que instalan) que dejan tocado el batterystats aunque flashees y reflashees.