Tienes varias maneras de hacerlo, flashear directamente un update.zip, flashear directamente una ROM que tenga el indicador de bateria en %, o crearte tu mismo un udate.zip para flashear desde recovery.
Si quieres prueba estos iconos de bateria

:
Download =>
http://www.multiupload.com/9NJRBFY0UA
Lo descargas, entras en modo Recovery y flasheas el .zip desde ahi.
Otra opcion es entrar en esta pagina, que suele tener lista de espera y te cocinas tu mismo los iconos de bateria, por los que mas te gusten:
http://uot.dakra.lt/kitchen
Deberas de subir a la pagina tu framework-res.apk y tu systemui.apk que los deberas de buscar con Root Explorer y pasarlos a tu sdcard externa (que en realidad es la interna, la unica que hay)
O si quieres puedes flashear alguna ROM que incluya el % de bateria, a mi personalmente el que mas me gusta es el de Cyanogen, que se activa en los ajustes de cyanogen:
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=230962
Pero hay muchas mas ROM que lo llevan, solo te puse un ejemplo.
Suerte