buenas compañero, antes que nada te aconsejo que te pases por el subforo de presentaciones para que te conozcan.
Y ahora al tema, a mi me pasó eso una vez y se me solucionó tan solo haciendo dos cosas aunque no se si de verdad fue por eso o no pero bueno te las comento, lo primero es tener cuidado al extraer el nexus siempre dándole a extraer desde el PC y luego al botón en el nexus y esperas un rato que la SD se desmonte no la quites del tirón.
Y también la formateé aunque esto es algo menos probable pero por intentarlo no pierdes nada, pásate las cosas al PC y formateala desde el recovery mismo o desde el pc de donde prefieras.