Me imagino que limpias cache con el twrp pero no veo la razón para hacerlo tan seguido mejor limpia la rom desde la app de seguridad.
Miui también lleva un gestor de batería que encuentras en la app de seguridad y en ajustes/batería ahi encuentras opciones para gestionar la bateria no veo necesario usar greenify.
Lo de las notificaciones no entiendo muy bien ¿quieres que no salgan? En ajustes/notificaciones/notificaciones de aplicaciones ahi buscas la aplicación y desactivas todo o lo que quieras desactivar.
Saludos espero haberte ayudado.
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