Bueno después de 1 día entero investigando, ya conseguí instalarlo, totalmente funcional, eso si de momento no me reconoce una tarjeta WiFi externa, creo debido al kernel, de momento no me importa por que testeo la seguridad de mis redes,igual este finde me pondré a ello.
Dejo el proceso como fue por si alguien le interesa. A sido mucho mas fácil de lo que pensaba. Testeado en Xiaomi redmi note 3 pro snapdragon.
Simplemente lo que hice , instalarme la ROM cyanogenmod 13, en mi caso la resurrección remix, ya instalada me baje el nethunter para nexus 5 marshmallows, y flasear, en una parte de la instalación dice que el equipo no es compatible, no se asusten, al tenerminar la instalación, ya tienes tu kali Nethunter instalado perfectamente,