En todas las basadas en cm13 hay que instalarlo al venir de miui, lo pongan o no.(en las AOSP igual)
El bootloader se bloquea al pasar de cualquier rom Android 6 a cualquier Android 5.1(el 90% de las miuis) y hay que desbloquearlo nada más instalar la rom 5.1 para que te inicie bien.
Ese recovery lo que hace es que si tu haces un backup de una rom miui 5.1 de absolutamente todas las particiones, puedes instalar una 6.0 y luego si quieres volver a 5.1 restauras ese backup de todas las particiones y no se bloquearía.
En definitiva(a no ser que hagas ese backup completo con ese twrp) al pasar de android 6 a cualquiera 5.1 con twrp tienes que abrir el bootloader justo antes de iniciar el teléfono