En ningún momento se usa la depuración USB para flashear la ROM, lo que utilizamos es el modo Download (EDL) y en el tuto se explica como instalar sus Drivers.
La depuración USB sería más o menos útil activarla si quieres flashear el recovery TWRP (aunque tampoco mucho) ya que lo único que se hace por adb es "reboot recovery". Se podría incluso flashear el recovery sin activar dicha opción mediante fastboot, "flash recovery recovery.img"... Quizás digas de activarlo porque has visto otros tutoriales en los que se usa un run.bat que creo que hace mediante adb "reboot edl" para entrar al modo Download directamente, pero nosotros omitimos ese paso y lo hacemos de manera manual, ya que mucha gente tiene error con eso.