Es raro. He descompilado la App y he podido encontrar varias librerías que comprueban si el Mobil esta rooteado. He creado un módulo de Xposed para intentar forzar el resultado de esos métodos, pero al menos en mi caso, lo que he podido comprobar es que no se están llamando a esos métodos. A vosotros os sale algún error en concreto? Algo como "su Mobil esra rooteado y no podrá funcionar esta aplicación" o algo así? (a mi no). De hecho sospecho que no me esta funcionando por otra cosa, pero no se porque.