Lo que cuentas sólo te ha sucedido a ti así que yo me plantearía efectivamente formatear todo pasando claro primero al PC lo que te interese conservar,yo siempre lo hago ya que pruebo primero las roms antes de subirlas y no hay ningún problema en luego restaurar desde la copia de MIUI ,eso si además de dicha carpeta copio y luego fusionó también la carpeta android.
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