A mi me paso una vez lo mismo y lo que me soluciono fue: sacar la bateria del S2, luego limpiar el conector usb con un cepillo de dientes que no utilizas y un poco de alcohol, luego de la limpieza del conector, con un desarmador pequeño, mover un poco el conector, enrectando un poco el conector, no con mucha fuerza, esperar unos minutos, hasta que seque y listo.
Hacer una instalación limpia con este tutorial:
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=776797
Y hacer pruebas, si se sigue calentando, por lo menos en mi caso, ya no se calento y ya entraba en deep sleep, si te sigue calentando, talvez tiene algun problema el conector, como te dijeron.
Espero que puedas solucionarlo.
Saludos.
