Realmente no entiendo la pregunta dado que me parecen dos teléfonos que juegan en ligas distintas.
Principales diferencias diferencias entre ellos:
Pantalla: 5,15'' IPS vs 5,5'' SuperAMOLED. Aquí a gusto de cada uno el tipo de pantalla y el tamaño.
Procesador: Kirin 935 vs Snapdragon 820. Mucho mejor el segundo, sobre todo en cuanto a gráficos, donde los Kirin siempre flojean.
Tarjeta SD: Huawei tiene, Xiaomi no.
Bandas 4G: Huawei soporta B20, Xiaomi no.
Radio FM: Huawei tiene, Xiaomi no.
Y alguna más que no me parece tan relevante. Así que en conclusión, si te gustan las pantallas grandes y más aún las AMOLED: Huawei. Si te importa mucho mucho tener banda de 800 MHz y radio FM (que hoy en día cada vez usa menos gente debido a la radio por Internet): Huawei.
En cualquier otro caso: Xiaomi. Mucho mejor rendimiento, más cómodo de usar (esto es una opinión personal, 5,5'' me parecen excesivas) y mucha mejor relación calidad/precio.
La tarjeta SD no la cuento como una variable decisiva ya que el Mi5 tiene versiones de 64GB y 128GB que seguramente nunca vayas a llenar y salen más rentables que las mismas versiones del Mate S.