Hola, son cosas de cada movil... a mi con el skid kernel para activar el led, me funciona con todas las notificaciones menos las llamadas perdidas y a todo el mundo les funciona con todo.... porque? No lo se..jeje ...
Sobre restaurar a fabrica, no lo he probado, supongo que no habría problemas, de todas formas yo haría una copia de seguridad con el TWRP por si acaso. El bootloader una vez abierto, ya no se cierra, no te preocupes, pero el roto si que lo perderás.
Saludos