Gracias fran1234 por tu respuesta.
Si, me temo que tienes razon, porque en el tiempo entre el post y ahora he estado haciendole un hard reset y poniendole la ROM de BQ sin ningun tipo de modificación y la carga del sistema no ha variado.
Ese problema que comentas de que se quedó rallado actualizando APPs también me pasó a mi una vez. Simplemente lo apagué entre en el recovery analicé las particiones y dejó de hacerlo (eso si, se tiró muuuuucho tiempo, pero en esta ocasión no se reiniciaba)
Voy a probar si con la ROM oficial de Kitkat también tiene esa carga brutal del sistema. Yo croe que si se solucionara eso por lo menos tendríamos un 30% mas de batería. (¿Idea para los expertos? ;) )
EDITO:
Acabo de probar la ROM oficial de Kitkat y la carga del sistema está en 16.29 y se mantiene ahí, por lo que algo en el código de BQ no debe estar muy bien si tiene el teléfono una carga así. Supongo que si se aplicaran un poco mas y disminuyeran eso los teléfonos aguantarían bastante mas la batería.