Hace siglos que no uso el S2U2 pero recuerdo perfectamente que se podía configurar 7 u 8 aplicaciones en las cuales el programa no se activaba su bloqueo de pantalla. Es evidente que yo tenía el TomTom como una de ellas. Para ello había que hacer cambios en el registro...
\HKEY_CURRENT_USER\Software\A_C\S2U2\ExceptionEXE0 ,1,2,3,4,5,6,7,8 y 9
Aunque ahora existe el programa S2U2C para configurar este programa que seguro permite hacer eso de forma fácil.
http://forum.xda-developers.com/showthread.php?t=442681
Saludos