Hola, lo de prime solo hace referencia a la versión de 32gb de cualquier modelo, los modelos a los que creo que te refieres son a Redmi Note 3 Pro 32gb (Prime) y Redmi Note 3 32gb (Prime), el mejor es el Pro que lleva el snapdragon 650 que es superior al Mediatek que lleva la versión no Pro.
Enviado desde mi Redmi Note 3 Pro