A mi eso me ha pasado alguna vez, el duplicado aparece pero sin datos, es decir aparece el contacto como lo tengo guardado, pero sin número de móvil o correo electrónico, sólo me ha pasado con uno o dos contactos como mucho.
Se le puede hacer ido la olla a la sincronización de contactos del móvil, vete tu a saber.
Mi solución fue eliminarlo y quedarme con el bueno.
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