Busqué info y es un bug de la versión 5 de Teclado de Google, también me ocurría. Limpiando datos y caché, y después desinstalando y volviendo a instalar, no se me arregló (entre otras cosas porque siguen quedando configuraciones locales guardadas que no sé dónde están, pero están). Tuve que hacer una instalación de la ROM entera con wipes completos y, ahora sí, ya me chuta correctamente.
Te propongo dos pruebas:
1 - Modificar en los ajustes de dispositivos de entrada los valores de la altura del teclado (opción nueva de la versión 5.0).
2 - Borrar datos y caché de la app, desinstalar y meterle a mano
la versión 5.1 (todavía en beta) del teclado de Google.