Si ya eres root... al flashear el cyanogen no pierdes el root.. lo conservas ;). Como?.. tan facil como tener el Rom manager, descargar la rom, ponerlo a la SD y desde el Rom manager ingresar al Recovery... desde el recovery flasheas la rom, previamente habiendo hecho un FULL WIPE. La rom cambia la rom (evidente) y el kernel... la Radio la pones tu.. a parte.