Prueba esto:
Copias todo el contedido de la SD en el ordenador
formateas la SD (no vale borrar archivos, hay que formatear)
restauras contenido de la carpeta en la SD
pruebas si ha mejorado algo.
En un par moviles que he tenido solucionaba los pequeños saltos en la grabacion de video de esta manera.
Se supone que las tarjetas de memoria no son como los discos duros, que no hace falta desfragmentarlas, pero te aseguro que a mi me ha funcionado, es la mejor forma de desfagmentar.
Un saludete.