Tener una copia de seguridad de la carpeta EFS es muy importante, hazla y para guardar aplicaciones y sus datos, como los juegos y sus partidas, yo uso el titanium backup.
Necesitas ser root para copiar la carpeta efs y para el titanium.
Por el tema de garantía, siempre que puedas volver a la rom oficial podrás hacer valer la garantía.