Eso pasaba con las versiones anteriores de GingerBread, que al llegar al "100%" el cargador dejaba de meterle carga a la batería y se empezaba a descargar. Lo hacían como medida de protección a la batería y alargar su vida útil.
Yo con la JVO y kernel voodoo cuando llega al "100%" ahí queda hasta que desenchufe el cargador como en Froyo. Te recomiendo que hagas wype y en caso de que siga haciéndolo vuelve a flashear.
A mí por lo menos con esta JVO no me pasa eso (y me alegro un montón

)
