El wipe es un reset que te dejará el movil con la phantom como recien instalada, sin niguna app y sin nada configurado, la sd no te la borra. Para hacer el wipe tienes que iniciar el movil en modo recovery y desde ese menu tienes para hacer el wipe.
Puedes reinstalar con SUT y marcar la opción "clear user data" como viene en las instrucciones de instalación de phantom y eso te hará lo mismo que el wipe.