No importa lo que ponga en el bootloader, no pierdes la garantía al formatear el nexus 5 (teniendo en cuenta que este dispositivo es sobre todo para desarrolladores). Hace poco contacté con la garantía, y pude hablar sin problemas con el técnico de que había formateado, rooteado, flasheado 293847923847 roms distintas...y en la misma conversación quedamos en que me mandaban otro n5 "nuevo" (dispositivo en stock seguramente arreglado).
El móvil venía como nuevo, y lo que es mejor, con sus propios 2 años de garantía desde el momento en el que llegó a mis manos.
Quizás esta entrada como fija sobre ya en este foro
