Pues después de volver a reinstalar, esta vez he usado kingroot. Todo funcionando perfecto con Android 6.0
Firmware instalado con el script:
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=985706
Root con kingroot.
Edito: Funciona estable y muy bien. Pero en cuanto la cyano este mas pulida me vuelvo otra vez a ella. En la stock no va el led de notificaciones y tampoco se enciende la pantalla al pasar la mano ni al sacarlo del bolsillo. Si funciona al cogerlo de la mesa pero no siempre funciona bien. Estas chorradas se hechan de menos en cuanto no las tienes.