No. Eso puede sucederte cuando tiene que rellenar los datos de la dalvik cache (el proceso de optimizando aplicaciones).
Asi que hasta que no borres la dalvik en el recovery, o vuelvas a instalar la rom desde cero, no tiene que volver a pasar por ese proceso.
Tambien tiene que optimizar aplicaciones cuando flasheas xposed, ya que al flashearlo borra la dalvik.
Un saludo.