No se quizas en el recovery te salga la emmc como unmount y pueda estar ahi el problema, proeba a ponerla unmount y luego mount emmc y reinicia.
Porque parece algun problema al montar la tarjeta... no tiene nada que ver con los 16gb hay gente que tiene 32 gb y sin problemas.
tambien puedes probar en lugar de en /emmc en /mnt/emmc.
Pero vamos tiene pinta de ser algo del montaje de la tarjeta.
Has reiniciado alguna vez desde que la has instalado?
Has echo algun wipe??? quizas esta pueda ser la razon tambien...
