Es cosa de la aplicacion de Whatsapp, lo que pasaba con las anteriores versiones de Whatsapp es que miraba tu carpeta de historial y eso para ver si el numero que habias introducido coincidia con el historial y entonces te pasaba directamente a la app, pero hace unas versiones lo actualizaron e hicieron que fuera obligatorio confirmar tu numero con SMS o Llamada.
Es decir, si quieres una respuesta corta, no hay nada que hacer, es cosa de Whatsapp.