Has probado primero a reiniciar en recovery (vol+/home/power)?
Y desde ahí volver a hacer el reset.
Si no es así, deberás instalar con Odin una rom stock normal JB 4.1.2 y en la misma operación instalar el Kernel Philz con root y recovery CWM y el zip de SuperSU para gestionar el Root. Una vez hecho esto tendrás un 4.1.2 con Root. A partir de ahí puedes ir subiendo de versión si quieres, recuerda que cada versión de Android precisa de un kernel específico sino te dará error al instalar.
Puedes quedarte en JB si quieres, pero mucha apps dejarán de actualizarse por eso entiendo que actualizar a MM es conveniente, y sí, quizás no sea tan ligero pero no se puede tener todo