Hola justo ayer pasé de jelly bean a cm13, me pasó lo mismo que a ti.. Lo hice así, rooteé, recovery por flashify, el patch de droith (bootloader), última nightly, gapps y listo.. Espero que te sirva
Edit: Este es el bootstack
https://mega.nz/#!q5lVETjR!voBZEGFdT...Shyjj1rgwkM_Fg
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