jconegar, creo que lo que tienes que hacer es modificar una opción en el activesync, creo que es algo de opciones de sincronización, pero no recuerdo cuál (no tengo la HD, y no tengo aquí el programa).
Lo que tienes que decirle es que sólo actualice de la HD al ordenador, y no al revés. Así, lo que valdrá será lo que tengas en la PDA, y la copia de seguridad será la del ordenador.
Un saludo.