1-Claro,hay varias,la "rebooter" por ejemplo.
2-Si los flasheos se hacen seguidos,siguelo igual que en el tuto y cuando instales el xposedsuport de xpirt haces un wipe cache/dalvik como te dice en el tuto y reinicias,solo sigue los pasos.
3.No,no se desinstala ya que son apks distintos,solo desinstalalo y listo.
Saludos.