Los tres cuadraditos en amarillo significan que IGO ha perdido el contacto con el GPS.
A mi me pasa algo parecido. Las primeras semanas de tener la Touch HD el TomTom me iba perfecto, pero ahora, de vez en cuando, TomTom tiene desconexiones intermitentes con el GPS. He probado con IGO y me ocurre lo mismo, de vez en cuando se me pone el radar en rojo y pierde la señal, la recupera y la vuelve a perder, y así indefinidamente. Cuando esto me ocurre he visto que arrancando el programa NoniGPSPlot, que además es gratuito, se consigue que el GPS vuelva a responder correctamente.
He buscado por Internet el problema, y en XDA-Developers he encontrado un foro en el que comentan este problema, y dicen que con la nueva versión de radio, la 1.10.25.25 parece que se resuelve. Yo todavía no lo he probado, porque me da un poco de miedo los cambios de ROM y estoy a la espera de que quede claro que la nueva versión resuelve el problema de las pérdidas de GPS.