Tal vez la rom que estas intentando flashear, bien no acepta el script, o bien ya soporta nativamente el ap2sd y al flashear el script 'lo escojonas' con perdon.....
Tambien puede deberse a que hayas instalado alguna aplicacion y se haya activado el ap2sd de froyo y al tener los dos activos, la rom se vuelva loca, asegurate de pasar todas las aplicaciones que hayas instalado a la memoria interna del movil antes de flashear el script...
