jejejeje por que flasheaste CM13 si no sabes como funciona???te quedó un poco grande el android 6 parece jejeje

...tu tranquilo a tu sd no le pasó nada...CN13 particiona la sd externa y la mitad la incorpora como almacenamiento interno y la otra queda normsal...
cuando vuelvas a otro tipo de rom la formateas y ya estrá normal...o formateala con el recovery...de echo en twrp podes ver si estan todos tus gigas intactos o no...
saludos
y