Lo más fácil es instalar desde recovery, ahí da igual donde guardes el zip aunque en la raíz es más fácil, apaga el móvil, pulsa botón apagar + bajar volumen y entras en modo fastboot, ahí con la tecla de bajar volumen baja una vez hasta que esté encima de recovery y pulsa subir volumen, ahora te sale un muñeco de android panza arriba con una exclamación, pulsa el botón de apagar durante un par de segundos y sin soltarlo da un toque a subir volumen y ya entra al recovery y puedes soltar el botón apagar, en el menú del recovery selecciona update from zip y busca el archivo donde lo pusiste, y ya está, se actualizará durante unos minutos y listo. Es muy fácil, yo me he complicado demasiado pensando que se flasheaba por fastboot y la he liado, hasta que salga el firmware completo me quedo sin móvil y sin probar Marshmallow, pero bueno, disfrutad vosotros por mí. ;)
Espero que te haya sido de ayuda, saludos!
