La verdad es que son totalmente diferentes, incluso puedes tener los dos si quieres. El HTC Home Customizer es un plugin para modificar el HTC Home, es decir, poner más pestañas, cambiar los iconos, cambiar el reloj, etc.
El Spb Mobile Shell va a parte, es para usar con el dedo y puedes tenerlo con el HTC Home.
Te dejo unos videos en los que puedes comprobar por tí mismo...
- HTC Home Customizer, te explican lo que hace con un ejemplo. Está en ingles pero seguro que lo entiendes entero.
- Spb mobile Shell, puedes ver como está el HTC home y el mobile shell.
Un saludo y espero haberte ayudado