Con un wipe perderás todo lo que esté en la memoria del teléfono (sms, configuración de algunos programas, puntuaciones en juegos, ...) pero es que todo eso yo ya lo daría por perdido si no consigues que te arranque el teléfono.
Los contenidos de la SD no creo que se deberían ver afectados en absoluto, pero desde luego si puedes hacer un backup de esos pues tanto mejor.
De hecho hay una cosa de la que me estoy acordando ahora y es que en algunos casos han sido problemas con la SD lo que hacía que no se pudiese arrancar el teléfono, por lo que puedes probar a quitar la SD y ver si mejora la cosa o no. En caso contrario pues no te quedará otra que hacer el wipe (y desde luego si lo envías al servicio técnico ellos no se van a andar con ninguna sutileza, borrar todo y empezar de nuevo)