Como comentan el whatsapp funciona de maravilla, y para las luces de notificaciones tienes que ser root en el nexus, de esa manera puedes descargar apps para tener las luces inferiores parpadeando para que te des cuenta de sms,llamadas, etcc.
Existe una app que ahora no recuerdo el nombre que hace que en la pantalla salga la llamada perdida o el sms moviendose en la pantalla en negro pero ahora no recuerdo el nombre, creo que es softkeys y creo que otra se llama NoLed