Ya lo he solucionado. Sólo hay que hacer un full unroot (si usas superSU). Abres SuperSU, vas a settings y en Cleanup le das a Full Unroot.
Luego tuve que bajar la ROM original de
www.nubia.cn (con el traductor de chrome te las puedes ir arreglando ya que está en chino). La primera vez tuve que cargar la ROM en manual pero una vez actualizado ya van las actualizaciones automáticas por OTA.
Para cargar la ROM de forma manual utilicé la aplicación Cliente vDM que viene de serie en el teléfono. Copias el zip con el archivo update en el raíz de la memoria interna y seleccionas la opción "Actualización desde disco". Seleccionas el archivo y aceptas y ya está.