Hola! Yo hice todo los pasos para rootear y tal y luego descubri que perdia la OTA asi que lo deshice para recibir la ultima actualización, pero en verdad da igual porque si pones una Rom luego la actualizarán con adroid 6 y ya está asi que la recibiras igualmente.
En cuanto a la garantía con motorola creo que la pierdes, ademas para desbloquear el Bootloader le tienes que pedir permiso a motorola asi que ya saben que lo has hecho y no hay manera de ocultarselo espero haberte ayudado